Если такие такие ошибки появляются где-либо на сайте, почтовике roundcube или в самом phpinfo(), варианта решения два: глобально и навсегда или локально для какого-либо сайта.
1) Глобально пропишите в /etc/php.ini:
date.timezone = "Europe/Moscow"
2) Локально на сайте в php файлах:
date_default_timezone_set("Europe/Moscow")